分子蒸餾是一種在高真空狀態下的非平衡蒸餾過程，蒸發器內高速旋轉的轉子對壁面上的液體進行連續刮擦，使液體均勻分散在蒸發壁面，再利用不同物質間分子自由程的差別，在遠低于液體沸點的溫度下將其分離。基于以上特點，特別適合于分離高沸點、熱敏性物料。
它的優點是：液膜厚度小，并且沿蒸發表面流動;被蒸餾物料在操作溫度下停留時間短，熱分解的危險性較小，蒸餾過程可以連續進行，生產能力大。
分子蒸餾是一種特殊的液--液分離技術，它不同于傳統蒸餾依靠沸點差分離原理，而是靠不同物質分子運動平均自由程的差別實現分離。
當液體混合物沿加熱板流動并被加熱，輕、重分子會逸出液面而進入氣相，由于輕、重分子的自由程不同，因此，不同物質的分子從液面逸出后移動距離不同，若能恰當地設置一塊冷凝板，則輕分子達到冷凝板被冷凝排出，而重分子達不到冷凝板沿混合液排出。這樣，達到物質分離的目的。
在沸騰的薄膜和冷凝面之間的壓差是蒸汽流向的驅動力，對于微小的壓力降就會引起蒸汽的流動。在1mbar下運行要求在沸騰面和冷凝面之間非常短的距離，基于這個原理制作的蒸餾器稱為短程蒸餾器。分子蒸餾有一個內置冷凝器在加熱面的對面，并使操作壓力降到0.001mbar。
該產品是一個工作在1~0.001mbar壓力下熱分離技術過程，它較低的沸騰溫度，非常適合熱敏性、高沸點物。其基本構成：帶有加熱夾套的圓柱型筒體，轉子和內置冷凝器;在轉子的固定架上精確裝有刮膜器和防飛濺裝置。內置冷凝器位于蒸發器的中心，轉子在圓柱型筒體和冷凝器之間旋轉。
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